logo NFI logo SMART Research BV
Выберите язык: English Español Français Português 中文(简体) 日本語 Русский
logo
shadow
Производительность

Программа Семейный поиск оптимизирована для вычисления отношений правдоподобий между профилями родителей—, братьев и сестёр— полукровных родственников и интересующих нас людей из большой базы данных(миллионы профилей). Эти отношения правдоподобия используются для определения наличия семейных отношений между ДНК-профилем, найденном на месте преступления, и ДНК-профилей в базе данных преступников. Семейный поиск обычно использует базу данных ДНК, состоящую из миллионов профилей, поэтому все алгоритмы нашей программа имеют значительную производительность для того, чтобы сократить время ожидания.

Семейный поиск Бонапарта является оптимизированным программным приложением. На графике изображён результат поиска одного интересуещего нас профиля из 520 000 профилей, взятых из кавказской демографической статистики.

Familial Performance
Рисунок 1:Затраченное время обычного компьютера на поиск одного профиля из 520000 профилей, включающих профиль родителей, детей, братьев, сестёр, полукровных родственников и профиль интересующего нас человека. Это время включает в себя загрузку и запись результатов.

На графике видно время, затраченное на весь процесс, включая загрузку профилей и запись результатов— без базы данных каждое процессорное ядро вычисляет около 100.000 совпадений в секунду:

Familial Match Monitor
Рисунок 2:Экран Семейного поиска показывает предупреждения (6 в данном случае): отношения правдоподобий между братьями или сёстрами. Каждый процессор вычисляет около 100000 таких показателей в секунду. В конце концов, ни один из них не превышает указанный порог (ОП = 1).

Сервер, используемый для получения результатов выше, был процессор Intel Xeon X5680 , 24 Гб памяти и два жестких диска по 1 Тб, RAID 1 (зеркальный дисковый массив), операционная система FreeBSD 8.2 Release. Эта машина - ведущий узел Бонапарта и база данных MySQL.

Август 29 2014, 09:24:19 / dab1f027c3a69b76c1d6af937b6bf98c807f711e
EnglishEnglish EspañolEspañol FrançaisFrançais PortuguêsPortuguês 中文(简体)中文(简体) 日本語日本語 РусскийРусский
SMART Research BV • Heyendaalseweg 135 • 6525 AJ Nijmegen • The Netherlands EU flag Cookies